・ワンピースは基本ライブ感で描かれており細かい整合性は無視されることが多い
・尾田は平気で設定を変えてくる(六式は覇気でしたなど)

これを踏まえたらクロコは昔は覇気を使えてた可能性は普通にある
なんならアラバスタ編での言動は全てなかったことのようにされててもおかしくない
エースは公式で2年前から武装覇気を使えてたってことになったし、実際ヤマトと戦えるくらいだから使えないの無理あるからな