まあ、実際検査とかしてる人には当たり前の事なんだが、
病原菌の付着していないユッケを作る方法はある。

味をしみこませるような処理のされていない、
なるべく大きな肉の塊を用意し、バーナー等で、通常焼いて食べるのと
同じ色になるまで全面を加熱し、後は清潔な刃物とまな板等でトリミングし、
火が通っていない部分をユッケとすればよい。

当然こんな工程をすればコストや手間がかかるので、お値段はお高くなりますが。