FMR-CARDも2諧調だからね。
16色の機種と2諧調の機種だとVRAMの構成が違うので、表示が変ってしまうのはしょうがないかな。
作った人が2諧調の事も意識していればそれなりに動くだろうけど、16諧調前提でパレットとか使っているとまともに見れないかも。