ハイシーズン(3月下旬〜4月上旬、GW、お盆、11月上旬〜12月上旬)の宿の予約は早めにすませましょう。
特に最盛期の11月上旬〜12月上旬になると京都のホテルや旅館は部屋を確保するのが非常に難しくなります。
旅行会社やカードのツアーデスク等、とにかく使える所は全て使いましょう。
旅窓などを携帯にブックマーク→30分おきにキャンセルをチェックというのも意外に有効。
どうしても予約が取れないときは近隣の都市(大津、草津、大阪、神戸、奈良、長岡京、高槻・・・etc)での宿泊を検討しましょう。

【宿検索リンク】
楽天旅窓 http://travel.rakuten.co.jp/
ベストリザーブ http://www.bestrsv.com/
一休.com http://www.ikyu.com/

複数の予約サイトを一括検索できる「Travel@nifty」も便利。
http://travel.nifty.com/jprsv/hotel/index.jsp

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京都 お勧め宿・ホテル その20
https://matsuri.5ch.net/test/read.cgi/hotel/1442984146/