本当に食い進んだ跡なの?。
容器の底だけ明るい黄土色になってるなら水分過多で腐ってるだけ。
そういう状況じゃないなら食べた跡が色違うのは普通にある。
色々気になってしょうがないなら、新しいのに交換したほうが健全的だよ。