95のプランを手直ししてみたがまぁこんな感じかな。
https://railway.chi-zu.net/86974.html

南港駅
〜4.5km〜
下寮川東岸の汐止坑口　標高100m
〜4.9km〜
永定渓の石碇子埔橋梁北岸　標高100m
〜0.2km〜
永定渓の石碇子埔橋梁南岸　標高100m
〜21.1km〜
高速国道5号線雪山隧道の宣蘭坑口　標高100m
〜13.3km〜
宣蘭駅
〜25.0km〜
蘇澳駅

蘇澳港FT
〜112km〜　ナッチャン麗娜輪で所要時間120分
与那国港FT

推定　南港宣蘭間44.0km　13分
参考　広島新岩国間44.2km　13分

石碇子埔に標高100m地点があるため長大トンネルは分割可能だが
灌漑用水0.5‰微勾配と同様に傾斜の向きは下流域で洪水決壊
させない必要があるためそれぞれの河川容量よりけりだね。