荷物預けるなら並ぶしかない
オンラインチェックインで通った時のパスポートチェックは、自分から搭乗カウンターに出向く、
呼び出される、呼び出しがなかった（気付かなかった）ら搭乗時に改札で止められてチェックされる
これらのどれかになる
セルフチェックインなら往復で買ってればパスポートスキャンするんでそれで終わり
片道（復路が別切り別キャリア）だとチェックイン不可でカウンターに行く事になると思う