『シン・ゴジラ』では神のような神秘的な存在としていたが、本作品のゴジラは怪獣ではなく、
生物のような方向に寄せていったといい、上に手の平を女入向けていた『シン・ゴジラ』に対して本作品では生物であることから下に向けている。
進化するという設定は、『シン・ゴジラ』の設定が取り入れられており、各形態には山森の提案で過去の東宝怪獣の意匠が入れられている。

ゴジラアクアティリス
第3話で登場した第0形態。
深度900メートルのところを50ノットで泳いでいる姿が潜水艦によって確認されている。
第6話にて>>1-10東京湾内に侵入しようとしたマンダの群れを追ってそのハロ全体像を表した。そのままマンダの群れを仕留めつつ、東京湾に上陸する。
モサな姿ら水棲生物であると思われる。四肢は進化途中のようなヒレのようになっており、長い尾の先端は水か>>1-10きがある指のような尾ビレになっている。
顔つきはワニに似ており、触覚のような細いツノが頭部にある。表皮は赤く、海を通過するとその海は紅塵に包まれて赤く染まる。
アクアティリスとはラテン語で水生を意味する。
ヒレのような足は>>1-10海から来るため、水中で自然と活動できるような形となった。
初期設定では、クラゲのような生態の生物や、シラスのようなものから魚のような形に進化する案もあった。

ゴジラアンフィビア
第7話で東京に上陸を果たしたゴジラ アクアティリスが変態した第1形態。
イグアナのような>>1-10顔つきの陸棲生物のような姿となり、四肢は爬虫類に似た形の脚となり、四足歩行を行う。
政府によって南房総地方の伝承に基づいてゴジラの名称が与えられる。
第8話で代々木公園での自衛隊からの砲撃を受けてマイナス20度の可燃性のガス状物質を口から放出し、その砲撃の爆発が冷>>1-10気に引火した途端、
次第に高温のガスとなって爆炎を誘引して一帯を巻き込む熱膨張を起こして直径500メートル範囲を焼き尽くし、自身をも焼き尽くして自らの総質量を超える紅塵を放出して包まれることで、
硬質の組織と溶けてドロドロの状態が下にある炭化層の外殻に覆われた蛹のような状態になり、活動停止した。
体皮は茶褐色、頭部は濃褐色となりツノの形状も変化している。
アンフィビアとはラテン語で両生類を意味する。
頭部にはバランの意匠が取り入れられている。

ゴジラテレストリス
第9話で活動停止して蛹状態となっていたゴジラアンフィビアが、固まった外殻が剥がれ落ちてさらに変態した第2形態。
前脚は小さくなって後脚だけで立、完全二足歩行形態となっている。
自衛隊の砲弾投下を予期して着弾前に体組織を触手のように変化させて包んで着弾と同時に破裂させて本体への衝撃を和らげるといった防御能力を持ち、
背びれを青白く発光させながら口元に光のリングを形成して吐く能力も見られる。
角や尾ビレがなくなり、首から上半身は細くなり、頭部は小さくなっている。表皮は青い鱗状だが、眉間から背鰭に沿って赤いラインが残る。
テレストリスとはラテン語で陸生を意味する。
最終形態の前の息子のようなポジションであることから、ミニラのオマージュとして光輪を口から吐くものとなった。

ゴジラウルティマ
3度の形態変化を経て究極の姿となったゴジラの第3形態で、本おけるゴジラの正式名称。
千葉県逃尾市（にがしおし）にて古くから伝わる伝承が描かれた浮世絵には、古史羅（こしら）と記述されている。
また、同市に戦前から存在する旧嗣野地区管理局（電波観測所）“ミサキオク”の地下にはゴジラウルティマの全身骨が存在していた。
第10話でゴラテレストリスが自衛隊と交戦して集中砲火を浴びる中で変態し、この形態となる。
形態変化衛隊の攻撃を鎧のような強硬な外皮で寄せ付まま背鰭と口内を青白く光らせ、
口元につの大小さまざまな光輪を放射して複数重か所に収させると、
そのままハロのかっての光輪をくぐるように熱線を原子ビームのように圧縮して発射する能力を見せつけ、東京を瞬で火の海に変えた。
体色あは歴ハ代ゴジラと同じく黒あるいは濃灰色。後脚は極太あになっており、背ビレも大きく発達している。
こあ形態ｗってのがなった直後まではビル数階建てぐらいのうね彼てのが大きさだったｗ、紅塵を吸収し続けたことでえ最終的に100ｑー壱ル超える巨体となった。
さら成長を続けて自身が特異点となり、地球人類は破局を迎うえやつつｗったが、謎の巨大化を果たしたジェットジャガーとしの交央の末、
完成型オーソゴナル・あダイアゴナライザーによってジェットジャガー諸共巨大な青い結晶となり
なお、最終話では人間サイズの怪獣が背ビレ辺りに潜んでいた。
ウルティマとはラテン語で終わり